序	日期	標題	法規類別
41.	100.03.30	核釋水污染防治法第十三條第一項、第十四條第一項、第十五條第一項解釋令：核釋向本署公告委託之機關申請「水污染防治措施計畫」及「排放許可證」之「委託」包含「委任」及「委託」之情形	行政規則
42.	100.05.25	廢淡水河系水污染管制區	實質法規命令
43.	100.05.25	廢台灣地區除淡水河系以外涉及二直轄市、縣（市）以上河川之水污染管制區	實質法規命令
44.	100.05.25	涉及二直轄市、縣（市）以上河川之水污染管制區	實質法規命令
45.	100.09.01	廢核釋水污染防治法第七十三條第八款所稱嚴重影響附近地區水體品質之行為	行政規則
46.	101.02.13	廢/停石油化學業與晶圓製造及半導體製造業放流水污染物削減管理計畫審核作業要點	行政規則
47.	101.08.21	和平溪水區及其水體分類	實質法規命令
48.	101.08.21	四重溪水區及其水體分類	實質法規命令
49.	101.11.12	廢核釋水污染防治法第七十三條第八款所稱嚴重影響附近地區水體品質之行為（101.11.12.訂定）	行政規則
50.	102.02.18	廢/停光電材料及元件製造業與科學工業園區污水下水道系統放流水污染物削減管理計畫審核作業要點	行政規則